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Text File  |  1995-03-04  |  2.1 KB  |  48 lines
  1. *****************************************
  2. * Cellulose-binding domain, fungal type *
  3. *****************************************
  4.  
  5. The microbial degradation  of cellulose and  xylans requires  several types of
  6. enzymes such as endoglucanases (EC 3.2.1.4),  cellobiohydrolases (EC 3.2.1.91)
  7. (exoglucanases), or xylanases (EC 3.2.1.8) [1].
  8.  
  9. Structurally,  cellulases  and  xylanases   generally  consist  of a catalytic
  10. domain joined to a cellulose-binding   domain (CBD) by a short linker sequence
  11. rich in proline and/or hydroxy-amino acids.
  12.  
  13. The CBD of a number of fungal cellulases has been shown to consist of 36 amino
  14. acid residues. Enzymes known to contain such a domain are:
  15.  
  16.  - Endoglucanase I (gene Egl-I) from Trichoderma reesei.
  17.  - Endoglucanase II (gene Egl-II) from Trichoderma reesei.
  18.  - Exocellobiohydrolase I  (gene Cbh-I)  from  Humicola grisea,  Phanerochaete
  19.    chrysosporium, Trichoderma reesei, and Trichoderma viride.
  20.  - Exocellobiohydrolase II (gene Cbh-II) from Trichoderma reesei.
  21.  
  22. The CBD domain is found either at the N-terminal (Cbh-II or Egl-II)  or at the
  23. C-terminal extremity (Cbh-I and Egl-I) of these enzymes. As it is shown in the
  24. following schematic representation, there are four conserved cysteines in this
  25. type of CBD domain, all involved in disulfide bonds.
  26.  
  27.                          +----------------+
  28.                          |          +-----|---------+
  29.                          |          |     |         |
  30.                   xxxxxxxCxxxxxxxxxxCxxxxxCxxxxxxxxxCx
  31.                          ****************************
  32.  
  33. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  34. '*': position of the pattern.
  35.  
  36. -Consensus pattern: C-G-G-x(4)-G-x(3)-C-x(5)-C-x(3)-N-x-[YW]-Y-x-Q-C
  37.                     [The four C's are involved in disulfide bonds]
  38. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  39. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  40.  
  41. -Expert(s) to contact by email: Henrissat B.
  42.                                 bernie@cermav.grenet.fr
  43.  
  44. -Last update: December 1992 / Text revised.
  45.  
  46. [ 1] Gilkes N.R., Henrissat B., Kilburn D.G., Miller R.C. Jr., Warren R.A.J.
  47.      Microbiol. Rev. 55:303-315(1991).
  48.